Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab3il1Q8VDV3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3il1Q8VDV3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms