Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Defb12Q8K4N3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Defb12Q8K4N3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms