Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcl3Q8BVF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcl3Q8BVF2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcl3Q8BVF2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms