Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik4Q8BMF5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Grik4Q8BMF5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grik4Q8BMF5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms