Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc93Q7TQK5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc93Q7TQK5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc93Q7TQK5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms