Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dnaaf3Q3UYV8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaaf3Q3UYV8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaaf3Q3UYV8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms