Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Srsf6Q3TWW8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srsf6Q3TWW8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srsf6Q3TWW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms