Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfixP70257 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfixP70257 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfixP70257 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfixP70257 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NfixP70257 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfixP70257 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfixP70257 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NfixP70257 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfixP70257 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NfixP70257 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfixP70257 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfixP70257 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfixP70257 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfixP70257 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfixP70257 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfixP70257 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfixP70257 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfixP70257 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfixP70257 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfixP70257 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfixP70257 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfixP70257 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfixP70257 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfixP70257 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfixP70257 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NfixP70257 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfixP70257 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfixP70257 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfixP70257 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfixP70257 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfixP70257 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfixP70257 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfixP70257 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfixP70257 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfixP70257 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfixP70257 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfixP70257 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfixP70257 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfixP70257 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfixP70257 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfixP70257 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfixP70257 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfixP70257 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfixP70257 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfixP70257 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfixP70257 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfixP70257 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NfixP70257 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfixP70257 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfixP70257 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfixP70257 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfixP70257 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfixP70257 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfixP70257 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfixP70257 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfixP70257 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfixP70257 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfixP70257 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NfixP70257 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfixP70257 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfixP70257 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfixP70257 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms