Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfybP63139 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfybP63139 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfybP63139 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NfybP63139 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NfybP63139 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NfybP63139 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NfybP63139 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfybP63139 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfybP63139 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfybP63139 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NfybP63139 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms