Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nol4P60954 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nol4P60954 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nol4P60954 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol4P60954 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol4P60954 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol4P60954 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol4P60954 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nol4P60954 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nol4P60954 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol4P60954 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nol4P60954 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms