Protein–RNA interactions for Protein: P59598

Asxl1, Putative Polycomb group protein ASXL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asxl1P59598 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Asxl1P59598 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Asxl1P59598 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Asxl1P59598 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Asxl1P59598 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms