Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp1P29452 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp1P29452 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp1P29452 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp1P29452 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms