Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lama1P19137 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lama1P19137 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lama1P19137 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms