Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hmgxb3G3X9M3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hmgxb3G3X9M3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hmgxb3G3X9M3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms