Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm21977F6U3N7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm21977F6U3N7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm21977F6U3N7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms