Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2610001J05RikF2Z3Y9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
2610001J05RikF2Z3Y9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms