Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3252E9PUT9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3252E9PUT9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3252E9PUT9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms