Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Nup160Q9Z0W3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Nup160Q9Z0W3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Nup160Q9Z0W3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nup160Q9Z0W3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms