Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl28Q9JIL2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl28Q9JIL2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms