Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc22Q9JIG7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc22Q9JIG7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc22Q9JIG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc22Q9JIG7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc22Q9JIG7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc22Q9JIG7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms