Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Xab2Q9DCD2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Xab2Q9DCD2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Xab2Q9DCD2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms