Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tsnaxip1Q99P25 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tsnaxip1Q99P25 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tsnaxip1Q99P25 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms