Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Abcd2Q61285 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Abcd2Q61285 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Abcd2Q61285 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms