Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rtl5Q5DTT4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rtl5Q5DTT4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rtl5Q5DTT4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rtl5Q5DTT4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms