Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VrtnQ3SYK4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VrtnQ3SYK4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VrtnQ3SYK4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms