Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Yy1Q00899 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Yy1Q00899 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Yy1Q00899 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms