Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux2P70298 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cux2P70298 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cux2P70298 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cux2P70298 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux2P70298 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux2P70298 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cux2P70298 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux2P70298 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux2P70298 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux2P70298 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux2P70298 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux2P70298 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux2P70298 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms