Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd13P70217 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxd13P70217 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd13P70217 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms