Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox5P52651 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox5P52651 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rhox5P52651 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms