Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Upp1P52624 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Upp1P52624 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp1P52624 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Upp1P52624 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upp1P52624 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Upp1P52624 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms