Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd8P23463 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd8P23463 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd8P23463 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd8P23463 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd8P23463 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd8P23463 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd8P23463 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd8P23463 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd8P23463 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms