Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Polr2aP08775 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2aP08775 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2aP08775 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms