Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01725 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01725 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01725 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01725 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01725 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01725 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01725 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01725 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01725 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01725 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01725 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01725 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01725 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01725 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01725 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01725 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01725 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms