Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkx6-2D3Z4R4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms