Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Scn7aB1AYL1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Scn7aB1AYL1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Scn7aB1AYL1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scn7aB1AYL1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms