Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trabd2bB1ATG9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trabd2bB1ATG9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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