Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Skint4A7TZF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skint4A7TZF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skint4A7TZF3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms