Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SQF0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1L1SQF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A1L1SQF0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1L1SQF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms