Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmgn5Q9JL35 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmgn5Q9JL35 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmgn5Q9JL35 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms