Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sft2d3Q9CSV6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sft2d3Q9CSV6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms