Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA1

Slc44a4, Choline transporter-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a4Q91VA1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc44a4Q91VA1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a4Q91VA1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc44a4Q91VA1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms