Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cep57l1Q8VDS7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep57l1Q8VDS7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cep57l1Q8VDS7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms