Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ApobrQ8VBT6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ApobrQ8VBT6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ApobrQ8VBT6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ApobrQ8VBT6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms