Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Frmd3Q8BHD4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frmd3Q8BHD4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms