Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc50Q810U5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc50Q810U5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc50Q810U5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms