Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc155Q80VJ8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc155Q80VJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc155Q80VJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms