Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2lQ7TS74 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ckap2lQ7TS74 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ckap2lQ7TS74 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms