Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SugctQ7TNE1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SugctQ7TNE1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms