Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Igbp1Q61249 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igbp1Q61249 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms