Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Prkaa1Q5EG47 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prkaa1Q5EG47 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prkaa1Q5EG47 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms